1. Cuci bersih daging sapi, lalu masukkan ke dalam panci berisi air. Rebus hingga daging empuk.
2. Angkat daging dan sisihkan. Kuah rebusan jangan dibuang.
3. Panaskan minyak goreng dalam wajan. Tumis bawang merah dan bawang putih hingga harum.
4. Masukkan daun salam, daun jeruk purut, serai, jahe, dan lengkuas. Aduk rata.
5. Tambahkan kecap manis dan gula pasir. Aduk kembali.
6. Masukkan bumbu ke dalam kuah rebusan daging. Aduk rata.
7. Masukkan daging sapi, tauge, kubis, dan tomat. Aduk rata.
8. Masak hingga semua bahan matang.
9. Sajikan soto daging madura dalam mangkuk dan tambahkan potongan jeruk nipis.